Crystal Fairy è un rompicapo a tempo e ad abbinamento 3 ambientato in un mondo in cui crescono diversi tipi di cristalli nelle grotte e in superficie. In 25 livelli, il giocatore aiuta la Fata dei Cristalli a far crescere creature magiche raccogliendo carte animali su tabelloni pieni di gioielli colorati. Si cerca anche di ottenere un punteggio estremamente alto.
Ci sono due modi per aiutare il giocatore a crescere le creature magiche.
Il giocatore può fornire questo aiuto solo attraverso un gioco di scambi match-3. Scambia due gioielli non abbinati per creare una linea orizzontale o verticale di almeno tre gioielli abbinati con una sola mossa. Ogni scambio li aiuta a far scorrere i pezzi di una carta animale, simili a pezzi di un puzzle, lungo le colonne fino alla fine del tabellone. Il gioco sposta poi i pezzi in un pannello in alto a sinistra per riformare la tessera.
Completare ogni compito prima che scatti il timer.
I giocatori devono completare ogni compito prima che il timer nell`area in basso a sinistra faccia il conto alla rovescia. In questa stessa area il giocatore può tenere traccia del proprio punteggio.
Cristallo fatato ha delle opportunità di power play.
La Fata dei Cristalli offre opportunità di power play. Quando il giocatore rimuove lo stesso colore di gioielli per due volte in una striscia non interrotta, il gioco attiva poteri utili utilizzando cristalli carichi che appaiono nell`area in alto a destra. I cristalli verdi rimuovono tre gioielli dal tabellone a caso, i cristalli viola ne rimuovono cinque in forma di più, i cristalli gialli aggiungono tempo extra, i cristalli blu rimuovono un gioiello sotto un pezzo di carta e i cristalli rossi ne rimuovono nove.