Dans Papas Cupcakeria, vous préparez des cupcakes pour une variété de clients. Vous pouvez choisir parmi deux personnages existants, ou créer le vôtre grâce à un large éventail d`options de personnalisation des personnages. Plus vite et mieux vous faites les cupcakes, plus votre score est élevé. Un score plus élevé signifie un plus gros pourboire en plus de votre salaire hebdomadaire. Vous pouvez utiliser votre salaire pour acheter des vêtements et des accessoires pour votre personnage ou des meubles pour décorer le magasin de cupcakes. Vous pouvez également débloquer de nouveaux clients au fur et à mesure que vous jouez.
A mesure que vous jouez, le jeu devient plus difficile car vous devez servir plusieurs clients en même temps. Comme le temps est un facteur lors de la fabrication des cupcakes, plus cela prend du temps, plus votre score sera faible. Il y a aussi des clients appelés "fermeurs" qui sont beaucoup plus difficiles que les autres. Même le fait de réussir leur commande en grande partie peut entraîner un mauvais score.
À la fin de chaque journée, vous obtiendrez un score. Si votre score est suffisamment élevé, vous monterez en grade. Vous obtiendrez également deux tickets chanceux qui vous permettront de jouer à un mini-jeu. En terminant le mini-jeu, vous recevrez de l`argent ou un vêtement ou un meuble pour votre magasin. Vous aurez également droit à une parade certains jours après le travail qui devient plus élaborée au fur et à mesure que vous devenez compétent.
Les décorations du magasin ont également une mécanique de jeu et sont notées par des points et la fraîcheur. Des points sont attribués pour regrouper des décorations d`un thème similaire. La fraîcheur est gagnée en changeant régulièrement vos décorations et en contribuant à votre score global. Plus votre score est élevé, moins les clients se soucieront de vous lorsqu`ils attendront que vous passiez leur commande, ce qui vous aidera à obtenir un meilleur score.