Hexa Sort Master est un jeu de puzzle logique de type bloc qui propose des tâches de tri à travers les niveaux. Sur un fond bleu dégradé, le joueur trie des piles de tuiles hexagonales de couleurs différentes sur des grilles composées de pavés gris aux motifs variés. Son objectif est de marquer des points, de gagner des pièces et de terminer des quêtes.
Le jeu exige que le joueur trie trois piles à la fois en fonction de la couleur et d`une icône imprimée sur le dessus de chaque tuile. Les icônes des tuiles comprennent des nuages, des gouttelettes, des flammes, des clés, des crânes, des étoiles et des épées. Le joueur ne peut utiliser que les espaces vides des pavés pour le tri. Il gagne des points après avoir réussi à trier les tuiles en piles suffisamment hautes.
Le joueur trie en faisant glisser une pile sur un pavé vide, puis en faisant glisser à côté une autre pile dont la couleur supérieure et l`icône correspondent. Le jeu retourne automatiquement la partie correspondante de la première pile sur la seconde. Si les tuiles colorées de la partie inférieure non couverte de la pile correspondent à des piles adjacentes, ces tuiles sont également automatiquement retournées dans une nouvelle position.
Si le joueur manque de place, Hexa Sort Master lui permet de retirer des piles, de les repositionner et de les mélanger. Avec ses gains de pièces, il peut acheter d`autres boosters au fil du temps.
À la fin d`un niveau, le joueur peut visionner une vidéo publicitaire pour recevoir des pièces supplémentaires. Il reçoit également des pièces, des vies de cœur, des vies de cœur infinies ou des boosters par le biais de cadeaux quotidiens lorsqu`il utilise une icône de calendrier sur l`écran d`accueil. S`il atteint certains objectifs, il reçoit des récompenses supplémentaires dans la fenêtre de quête accessible via une icône de défilement sur le même écran.