Cube Commander est un jeu de combat qui combine des éléments de cube, des mondes d`artisanat et des jeux de gestion. Le joueur, par l`intermédiaire d`un avatar portant une couronne, est le commandant d`une armée qui doit combattre les zombies et autres monstres qui sévissent dans les forêts, les marais et d`autres environnements. Il collecte des ressources, notamment des lingots d`or et d`argent, pour constituer une armée de guerriers portant des épées, d`archers et d`autres combattants. Ils utilisent également leurs richesses pour se perfectionner et améliorer leur santé, leurs dégâts, leur vitesse, leur capacité d`empilement et d`autres éléments. Après avoir collecté suffisamment de lingots d`argent pour acheter des tentes qui génèrent des guerriers porteurs d`épée, il utilise une zone de charge pour ordonner aux guerriers de charger l`ennemi. Ils collectent également par intermittence des lingots d`argent et d`or supplémentaires pendant que les guerriers distraient les zombies. Le joueur peut augmenter la vitesse à laquelle il ramasse les lingots en regardant une publicité pour gagner un outil aimanté.
Cube Commander ne force pas les joueurs à regarder beaucoup de publicités comme les jeux similaires. Cela dit, le joueur ne peut accéder à certains outils et armes qu`en regardant des publicités, comme une catapulte qui tire des TNT sur les troupes ennemies.
Il est important de noter que le joueur peut également stocker des lingots d`or supplémentaires dans un coffre avant que le jeu ne passe au niveau suivant. Il peut ensuite retourner au coffre et récupérer les lingots pour monter en niveau ou acheter des objets nécessaires.