Cover Orange 2 est un jeu de logique et de réflexion. Sur 60 niveaux, le joueur utilise ses connaissances en physique pour aider des oranges anthropomorphes à se mettre à l`abri afin d`éviter une pluie mortelle qui tue au contact. Ils tentent également d`obtenir un meilleur score et trois étoiles par niveau.
Chaque scène présente un scénario complexe dans lequel un ou plusieurs oranges doivent se mettre à l`abri sous des planches de bois préfabriquées ou d`autres matériaux, sous le regard de divers animaux. Le joueur doit trouver le "truc" qui fonctionne le mieux pour se protéger. Par exemple, il peut déposer une orange devant un ventilateur puissant pour que l`air la fasse rouler jusqu`à ce qu`elle se mette à l`abri sous une planche.
Le joueur obtient le score le plus élevé et le plus grand nombre d`étoiles lorsqu`il trouve la solution et accomplit la tâche rapidement. Pendant que le nuage de pluie dérive de la gauche vers la droite de l`écran, il doit également chercher une étoile qui apparaît près d`un animal et la sélectionner avant que l`animal ne la cache. S`ils ne parviennent pas à obtenir trois étoiles par niveau, ils peuvent utiliser un bouton de recharge pour réessayer.
Cover Orange 2 propose plusieurs outils utiles. Le joueur reçoit un aperçu semi-transparent de plusieurs objets qu`il peut déposer dans une scène dans la zone supérieure gauche. Il peut utiliser un bouton d`avance rapide en bas à gauche pour accélérer le mouvement du nuage et un bouton d`avance rapide séparé en bas à droite pour sauter un niveau.