Dans un décor bleu royal, le joueur tente de gagner le plus de points possible et de se classer en tête du classement en tirant des projectiles de bulles sur des rangées de bulles multicolores suspendues qui ressemblent à des gommes à mâcher, afin d`éliminer des groupes de trois bulles ou plus à la fois.
Le joueur ne fait pas éclater les bulles dans les rangées. Au lieu de cela, la grappe de bulles correspondantes tombe au fond du champ. Les bulles rebondissent au sommet des zones de points. Chaque fois qu`une bulle s`arrête, elle éclate et le jeu récompense le joueur avec le nombre de points dans cette zone.
Si le projectile ne correspond pas à au moins deux bulles connectées sur le terrain, le joueur peut l`échanger avec un deuxième projectile. Il peut bénéficier de cette option jusqu`à trois fois. Ensuite, il doit visionner des vidéos pour continuer à échanger des projectiles.
Bubble Shooter Free 3 propose deux types de boosters pour aider le joueur à gagner des points plus rapidement. Ils peuvent tirer trois fois gratuitement sur des bombes rondes et dorées rendues accessibles près du coin inférieur gauche. Lorsqu`ils effectuent des tirs groupés consécutifs, comme le montre une barre incurvée dans le lanceur, ils reçoivent un projectile de boule dorée tourbillonnante qui peut être de n`importe quelle couleur.