Squirrel Bubble Shooter comienza con muchas burbujas de diferentes colores en la parte superior de la pantalla. El jugador, que es una ardilla, se sitúa en la parte inferior de la pantalla. Las burbujas están a veces agrupadas con otras del mismo color. El personaje de la ardilla recibirá una burbuja de un color específico. Lanza esa burbuja al aire hacia una burbuja del mismo color y una vez que las burbujas chocan, desaparecen todas las burbujas que estaban tocando. Después de eliminar todas las burbujas de la pantalla, el nivel se ha completado y el jugador pasa al siguiente nivel. En cada nivel el jugador es recompensado con puntos, dependiendo de la rapidez con la que haya completado el nivel. Para que las burbujas estallen, deben estar tocando al menos otras tres burbujas del mismo color. Además, si hay burbujas de otro color pegadas a la parte inferior de las burbujas reventadas, estas burbujas extra caerán al suelo del nivel y reventarán. La ardilla puede lanzar una burbuja hasta donde quiera. Lanzar la burbuja a otra burbuja o incluso rebotar la burbuja en la pared primero es una opción.
El juego tiene un fondo de selva de colores brillantes que se acompaña de música con temática de selva. El juego es divertido y mantiene un ritmo rápido de juego. El juego recompensa a los jugadores con puntos por jugar rápido, así que asegúrate de lanzar las burbujas tan rápido como puedas para alcanzar el siguiente nivel.
