Marble Bubble Legend es un juego de fusión con jugabilidad Suika y elementos de diseño Zuma. En un campo de pelota mesoamericano cubierto de hierba y con paredes laterales de piedra, el jugador utiliza un lanzador de ranas similar a los que se encuentran en los juegos de explotar burbujas de Zuma para crear canicas cada vez más grandes en el otro extremo del campo. También intentan conseguir una puntuación alta y la moneda estrella.
La rana tiradora lleva un proyectil de canica principal en la boca y otro secundario visible en la espalda. El jugador recibe una lÃnea de punterÃa discontinua que puede utilizar para apuntar a puntos especÃficos en el otro extremo del campo de juego. La burbuja en el tÃtulo del juego se refiere a cómo las bolas de mármol ruedan aparentemente hacia arriba como burbujas flotantes debido a la disposición vertical de la pantalla.
El jugador puede disparar las canicas a cualquier parte de la pista, pero sólo puede unir dos burbujas idénticas a la vez. Si permiten que se amontonen burbujas que no coinciden y las piezas llegan al fondo de la pantalla, pierden y deben volver a empezar.
Marble Bubble Legend ofrece varias herramientas para proteger al jugador contra una pérdida. Si el jugador está dispuesto a ver anuncios, pueden utilizar el botón inferior izquierdo etiquetado AD para eliminar la canica más grande que impide nuevas fusiones. También puede utilizar el botón inferior derecho de sacudir para agitar las canicas y colocarlas en nuevas posiciones de fusión, y el botón multibola de remolino arco iris para fusionar y evolucionar inmediatamente una canica determinada. El acceso a los dos últimos botones se adquiere con estrellas que se ganan visitando la tienda del juego y viendo vÃdeos publicitarios.