Goods Sort 3D es un juego de clasificación y simulación cronometrado. En diferentes salas a lo largo de los niveles, el jugador debe clasificar una mezcla de productos domésticos comunes dispuestos en filas de tres elementos dentro de contenedores tipo cubo montados en las paredes antes de que se le acabe el tiempo. Aunque las habitaciones se parecen más a las despensas de una casa que a las de una tienda, en esencia realizan tareas propias de un empleado de almacén.
En los contenedores se almacenan bebidas embotelladas y enlatadas, alimentos en caja, dulces, huevos decorados, frutas y verduras, artÃculos de salud e higiene, productos de maquillaje, golosinas para mascotas, material escolar y de oficina, aperitivos y juguetes. El jugador clasifica los productos utilizando los huecos de la parte delantera de cada contenedor. Cuando forman un conjunto de productos iguales, los artÃculos desaparecen y las piezas de la fila de atrás se deslizan hacia delante. El jugador debe seguir clasificando hasta que no queden más artÃculos en las estanterÃas.
Goods Sort 3D recompensa al jugador con monedas por cada victoria y cuando ve anuncios. El jugador puede usar las monedas o los anuncios adicionales para comprar potenciadores. El botón de bomba de la parte inferior izquierda clasifica automáticamente y elimina tres objetos iguales con un solo movimiento. El botón contenedor de la parte inferior derecha añade un cubÃculo extra a la pared para disponer de espacio de clasificación temporal.