Cubito es un arcade, endless runner que presenta elementos similares a los juegos de la serpiente. Un jugador debe dirigir una serpiente o tren hecho de cubos magenta por dos pistas hechas de cubos verde neón suspendidos en una región púrpura similar al espacio exterior. Su única tarea es mantener los cubos en una de las dos pistas durante el mayor tiempo posible para conseguir su mejor puntuación.
Al igual que en los juegos de serpientes, el jugador puede perder cubos de su serpiente/tren si no consigue dirigirla alrededor de los obstáculos de las pistas, incluyendo paredes moradas y barreras rosas. Las vÃas también tienen huecos cortos y anchos que pueden dificultar al jugador calcular las distancias y las vÃas restantes disponibles en una sección. El juego cuenta con pistas rojas invertidas que son mortales al tacto y expanden y contraen las pistas verdes, lo que dificulta aún más la medición de los huecos. Además, existen cubos de velocidad blancos con flechas que hacen que los cubos del jugador se muevan por una pista demasiado rápido.
Cada vez que el jugador golpea un obstáculo o no consigue mantenerse parcialmente en una pista verde, pierde cubos magenta. Si sus cubos chocan contra una barrera o caen por un hueco, pierden la partida. Deberá reiniciar la partida e intentar superar su última mejor puntuación.
Cubito proporciona una herramienta de curación para dar al jugador la oportunidad de seguir por las pistas verdes. Cada vez que el jugador dirige los cubos a través de un cubo magenta con un corazón en él, toda la serpiente/tren vuelve a su tamaño original.