Color Water Sort 3D es una versión tridimensional de los populares juegos de clasificación clásicos que requieren que el jugador clasifique bandas de diferentes colores de agua en tubos de ensayo de laboratorio separados y otros recipientes. En esta versión, el jugador también debe jugar lo suficientemente rápido como para ganar tres estrellas de oro.
A lo largo de los niveles, el jugador transfiere las bandas de colores de agua. Cuando llenan un tubo de ensayo con un color, el juego lo tapona con un tapón y dispara ráfagas de confeti a la pantalla. Cuando completan un nivel, reciben estrellas y monedas de oro. Pueden multiplicar sus ganancias de monedas parando una flecha en un indicador multiplicador de X2 a X5. También pueden ganar monedas abriendo una hucha y jugando a una ruleta en la pantalla de inicio, aceptando una caja de regalo de recompensa de progresión y recogiendo llaves para abrir cofres del tesoro.
Si el jugador comete un error, puede utilizar el botón de deshacer situado en la parte superior derecha de la barra de progreso de estrellas horizontal de la parte superior central. Si necesita añadir una probeta más, puede utilizar el botón de añadir situado en la parte superior izquierda de la barra. El juego también les permite ver una pista con el botón de lupa en la esquina superior derecha o saltarse un nivel por completo con el botón de flechas en la esquina superior izquierda debajo del botón de inicio.
Color Water Sort 3D permite al jugador personalizar su experiencia con las monedas que gana. Pueden usar las monedas para desbloquear nuevas formas de tubos de ensayo, fondos y tapones aleatorios.
