Words in Bubbles ist ein Wortspiel, das ein Blasen-Stopp-Element und ein themenbasiertes Spiel bietet. In jedem Level ist es das Ziel des Spielers, Wörter aus Teilbuchstaben in Blasen zu bilden, die vom oberen Bildschirmrand in einen klaren Behälter mit rundem Boden fallen. Der Spieler muss jedes Wort richtig erraten, um alle Blasen aus dem Behälter zu entfernen, Münzen zu gewinnen und den nächsten Level freizuschalten.
Das Spiel präsentiert dem Spieler einen thematischen Hinweis und leere Wortfelder in der oberen Mitte des Bildschirms. Der Spieler benutzt die Buchstaben in den Blasen, um die Lücken zu füllen. So kann er zum Beispiel aus Teilbuchstaben Wörter bilden, die Gegenstände in einem Raum beschreiben, Objekte, die mit einer Farbe oder einer Jahreszeit assoziiert werden, oder die Namen von Tieren, Pflanzen und sogar Planeten. Sie können nur dann Wörter bilden, wenn sie die Teilbuchstabenblasen in der richtigen Reihenfolge auswählen. Allerdings können sie eine falsche Blase jederzeit wieder abwählen.
Words in Bubbles bietet mehrere Hilfsmittel, um die Auswahl zu erleichtern. Der Spieler kann mit der grünen Hinweislupe nur die Blasen markieren, die ein Wort bilden, mit dem orangefarbenen Blitzknopf einige Buchstaben in den Wortfeldern aufdecken oder mit dem blauen Doppelpfeilknopf die Blasen im Behälter mischen. Mit ihren Münzen können sie im Laufe der Zeit mehr Zugang zu diesen Werkzeugen kaufen. Wenn sie die Münzen vermehren wollen, müssen sie einfach Werbevideos ansehen.