In Papas Cupcakeria backst du Cupcakes für eine Vielzahl von Kunden. Du kannst aus zwei vorhandenen Charakteren wählen oder deinen eigenen mit einer Vielzahl von Optionen zur Charakteranpassung erstellen. Je besser und schneller du die Cupcakes machst, desto höher ist deine Punktzahl. Eine höhere Punktzahl bedeutet ein größeres Trinkgeld zusätzlich zu deinem Wochenlohn. Mit deinem Lohn kannst du Kleidung und Accessoires für deine Figur oder Möbel zur Dekoration deines Cupcake-Geschäfts kaufen. Im Laufe des Spiels kannst du auch neue Kunden freischalten.
Im Laufe des Spiels wird es immer schwieriger, da du mehrere Kunden gleichzeitig bedienen musst. Da Zeit ein Faktor bei der Herstellung von Törtchen ist, wird deine Punktzahl umso niedriger sein, je länger es dauert. Es gibt auch Kunden, die so genannten "Closer", die viel wählerischer sind als die anderen. Selbst wenn du ihre Bestellung größtenteils richtig machst, kann das zu einer schlechten Bewertung führen.
Am Ende eines jeden Tages erhältst du eine Bewertung. Wenn deine Punktzahl hoch genug ist, steigst du in der Rangliste auf. Außerdem erhältst du zwei Glücksscheine, mit denen du ein Minispiel spielen kannst. Wenn du das Minispiel abschließt, erhältst du entweder Geld oder ein Kleidungsstück oder Möbel für deinen Laden. Außerdem gibt es an manchen Tagen nach der Arbeit eine Parade, die umso aufwändiger wird, je kompetenter du wirst.
Die Ladendekorationen haben auch eine Spielmechanik und werden nach Punkten und Frische bewertet. Punkte gibt es für die Gruppierung von Dekorationen mit ähnlichem Thema. Frische erhält man, indem man seine Dekorationen regelmäßig austauscht und so zu seiner Gesamtpunktzahl beiträgt. Je höher deine Punktzahl ist, desto weniger Kunden werden sich Sorgen machen, wenn sie darauf warten, dass du ihre Bestellung aufgibst, was dir hilft, eine höhere Punktzahl zu erreichen.