Pac-Rat ist ein Puzzle-Arcade-Spiel im Labyrinth-Stil, das dem klassischen Pac-Man ähnelt. Eine Ratte versucht, Cheddar-Käsestücke und -Räder in Labyrinthen auf sechs Ebenen zu essen. Dabei wird sie von mehreren herumstreunenden Katzen bedroht. Die Aufgabe des Spielers ist es, der Ratte zu helfen, lange genug am Leben zu bleiben, um den ganzen Käse zu fressen.
Sobald Kinderstimmen rufen: "Mach dich bereit... los!", muss der Spieler in jedem Labyrinth Strategie und Elemente einsetzen, um die Katzen daran zu hindern, die Ratte zu fangen. Sie können die Ratte einfach durch Beobachtung von jedem Bereich fernhalten, in dem sich eine Katze befindet. Da auch die Katzen die Ratte jagen, kann der Spieler die Ratte dazu bringen, eines von mehreren Rädern zu fressen, um ein Power-Up zu erhalten, das die Ratte vorübergehend in ein grünes Monster verwandelt, das Katzen frisst. Wenn die Ratte sich verwandelt, schreien die Katzen und laufen weg. Wenn die Ratte eine von ihnen frisst, ist der Geist der toten Katze gezwungen, in sein Heimatgebiet zurückzukehren, um wieder aufzuerstehen, was dem Spieler Zeit gibt, die Ratte anzuweisen, weitere Käsescheiben zu fressen.
Pac-Rat bietet zwei zusätzliche hilfreiche Spielfunktionen. Es bietet portalartige Tore auf der linken und rechten Seite jedes Labyrinths, die der Spieler nutzen kann, um die Ratte schnell von einer Seite zur anderen zu bringen. Außerdem hat die Ratte drei Leben zur Verfügung. Wenn nur noch ein Leben übrig ist, kann der Spieler ein Level von vorne beginnen, ohne dass er gezwungen ist, jedes Level erneut zu spielen.