Mobile Run ist ein dreidimensionales Arcade-Laufspiel, bei dem der Spieler sein Handy durch das Sammeln und Benutzen von Apps sicher über einen auf dem Wasser schwimmenden Hindernisparcours mit 55 Levels steuern muss. Auf der Strecke befinden sich mit App-Symbolen markierte Tore und ein schwarz-weißer Ring, der als Ziellinie dient. Die Rennstrecke setzt sich nach dem Zielring mit einem Multiplikator-Abschnitt fort.
Wenn der Spieler bereit ist, Werbung zu sehen, kann er zwei zufällige Apps sammeln, bevor er den Lauf beginnt. Während des Rennens steuert er das Handy durch ein Tor. Dann muss er schnell eine oder mehrere Apps aktivieren, um eine Reihe von Hindernissen zu überwinden, wie z. B. Stacheln am Boden und rotierende Sägeblätter. Der Spieler kann das Handy nicht versehentlich von der Strecke ins Wasser lenken. Stößt er jedoch mit dem Handy gegen ein Hindernis, muss er den Lauf neu starten.
Die Apps in Mobile Run bieten nahezu unbegrenzte Möglichkeiten. Zum Beispiel kann der Spieler das Handy springen oder schweben lassen, Explosionen auslösen, Hindernisse mit Blitzen treffen und sogar kleine Strichmännchen anweisen, Hindernisse zu zerstören.
Der Spieler kann auch vor einem Lauf aufleveln, wenn er bereit ist, sich Werbung anzusehen. Die Werbeoption gilt auch für das Ändern der Haut des Telefons von Gelb zu Pink, Camouflage, Grau oder einer Spielkonsole.