Merge Combo ist ein Zusammenführungsspiel im Stil von 2048, das einzigartige Sortier- und andere Elemente bietet. In einem Raum mit hellblauen Wänden und einem Holzboden sortiert der Spieler Stapel von nummerierten farbigen Blöcken, um passende Blöcke zu kombinieren und so Blöcke mit der nächsthöheren Nummer zu schaffen. Außerdem versucht er, eine hohe Punktzahl zu erreichen, bevor ihm die Züge ausgehen.
Das Spiel zeigt die Nummer des Levels über einem Fortschrittsbalken im oberen linken Bereich und den aktuellen Punktestand des Spielers im oberen rechten Bereich an. Der Spieler kann seinen Punktestand jederzeit erhöhen, indem er sich eine Anzeige ansieht.
Im Gegensatz zu vielen anderen Sortierspielen kann der Spieler bei Merge Combo einen Block auf einen nicht passenden Block legen, um einen oder mehrere Blöcke freizulegen, die für die Zusammenführung benötigt werden. Es macht das Sortieren von Level zu Level schwieriger, indem es Blöcke zu den verbleibenden Blöcken des vorherigen Levels hinzufügt.
Wenn der Spieler zwei oder mehr übereinstimmende Blöcke zusammenfügt, verschwinden diese Blöcke und es erscheint ein neuer Block mit der nächsten Zahl. Zum Beispiel werden zwei 2er-Blöcke zu einem 3er-Block verschmolzen.
Befindet sich in einem Stapel ein Block mit der nächsten Zahl direkt unter einem der Blöcke eines Paares, verschmilzt der neue Block automatisch mit diesem, um einen weiteren neuen Block mit der nächsthöheren Zahl zu bilden. Dies ist ein "Combo"-Zug. Der Spieler kommt in einem Level schneller voran und erhält mehr Punkte, wenn er Combos ausführt.