Jelly Quest Mania ist ein 3-Gewinnt-Spiel, das auf einer Insel spielt, die sowohl warme als auch kalte Temperaturzonen aufweist. Wie bei ähnlichen Spielen verbindet der Spieler drei oder mehr Objekte der gleichen Art, in diesem Fall bunte Gelees, um sie vom Brett zu entfernen. Er muss eine bestimmte Anzahl verschiedener Arten von Gelees sammeln, die in der oberen rechten Ecke des Bildschirms angezeigt werden, wie z. B. blaue Sterne, orangefarbene Kreise und lila Blumen, bevor die Zeit abläuft.
Das Spiel ändert die Form des Spielbretts auf verschiedenen Ebenen, was bedeutet, dass der Spieler möglicherweise um Lücken herumarbeiten muss, an denen keine Formen angebracht sind. Außerdem sperrt es einige Gelees unter Metallstangen ein. Wenn dies geschieht, kann der Spieler die Jellies nicht bewegen oder benutzen, bis er sie durch Verbindungsspiele um sie herum entriegelt (d. h. zwei passende Jellies gegen das eingesperrte Jellies in Position gebracht hat). Einige Gelees verändern auch ihr Aussehen, weil sie sich auf dem Spielbrett umdrehen.
Wenn der Spieler keine Züge mehr machen kann, ordnet das Spiel automatisch die Positionen aller Geleeformen neu an. Der Spieler hat auch die Möglichkeit, Verstärker zu kaufen und zu benutzen, wie z.B. einen Hammer, der nur ein Gelee auf einmal entfernt. Wenn der Spieler gewinnt, erhält er bis zu drei goldene Sterne und Münzen.
