Girl Surfer 3D ist ein Rennspiel, das in einem dreidimensionalen Wasserpark spielt, in dem die Figuren schwimmen, surfen und Wasserfahrzeuge benutzen. Ein Mädchen auf Skiern, das hinter einem Jetski hergezogen wird, braucht Hilfe, um die Wellen zu manövrieren. Der Spieler führt sie durch vertikal hängende Goldmünzen, um diese einzusammeln. Er hilft ihr auch, andere Mädchen zu retten, die im Wasser feststecken, und um eine Vielzahl von Hindernissen herum zu manövrieren.
Alle vom Spieler geretteten Schwimmer schließen sich dem Surfer hinter dem Jetski an und bilden eine Pyramide. Der Spieler muss dann diesen Charakteren helfen, die Hauptaufgaben zu erfüllen, nämlich mehr Münzen zu sammeln, mehr Mädchen zu retten und Zusammenstöße mit Felsbrocken und anderen Objekten zu verhindern.
Wie bei ähnlichen Renn- und Rush-Spielen, z. B. Stickman- und Pencil-Rush-Spielen, gibt es auch bei Girl Surfer 3D am Ende der Strecke eine Multiplikatorstrecke. Der Jetski rast eine Rampe hinauf und schleudert die Mädchen in die Luft und die Multiplikatorstrecke hinunter. Der Bereich, in dem die Mädchen auf der Strecke im Wasser landen, verändert den Grad des Erfolgs des Spielers.
Das Spiel bietet dem Spieler auch die Möglichkeit, die Menge der gesammelten Goldmünzen zu erhöhen, mit denen er später Skins kaufen kann, die das Aussehen der Mädchen verbessern. Dazu muss er sich lediglich eine Werbung ansehen. Sie können auch neue Skins anprobieren, indem sie sich Werbung ansehen.