Gem Twins ist ein Geschicklichkeits-Puzzlespiel mit klassischer pixeliger Arcade-Grafik. Zwei Brüder sind auf der Suche nach Abenteuern und schwebenden Pflanzenzwiebeln in 27 Stufen (Levels) von unterirdischen Räumen. Die Brüder sind nicht ganz normal. Sie können sich in Edelsteine verwandeln. Diese Gabe ist von Vorteil. Sie erleichtert es ihnen, schwierige Bereiche zu erreichen und Fallen und Hindernisse zu umgehen. Das Ziel des Spielers ist es, die Aktionen der Zwillinge so zu steuern, dass sie im regulären und im Speedrun-Modus das Ziel erreichen.
Der Spieler kann jeden der Zwillinge so steuern, dass er läuft und springt. Er kann auch jeweils einen Bruder anweisen, vorübergehend auf dem Boden oder in der Luft zu verharren. Mit dieser Fähigkeit kann er mit einem Bruder eine schmale Plattform erschaffen und dann den zweiten Bruder anweisen, diese Stelle als Sprungpunkt zu nutzen, um hohe Wände, Stufen und andere Hindernisse zu überwinden. Da sie einen Bruder mitten im Sprung einfrieren können, können sie diese Edelsteinplattform über dem Boden erschaffen. Sie können sie an einem oder mehreren Punkten auf halber Höhe einer Wand errichten.