Fruit Fusion ist ein Fusionsspiel aus der Unterkategorie Suika. Der Spieler fügt zusammenpassende Früchte zusammen, um neue zu schaffen, bis er die Stücke zu Wassermelonen entwickelt hat. Sie versuchen auch, die höchstmögliche Punktzahl zu erreichen.
Das Spiel präsentiert dem Spieler einen regalähnlichen Behälter in einem Dschungel. Die aktuellen und nächsten Fruchtstücke erscheinen nicht wie bei anderen Suika-Spielen oben auf dem Behälter. Stattdessen werden die verfügbaren Stücke mit einer Hand markiert, die sich über eine Evolutionslinie bewegt, die unter dem Regal hängt. Ein Sternsymbol auf einem Stück zeigt die aktuelle Top-Evolutionsleistung an.
In ähnlichen Spielen verwendet der Spieler eine Ziellinie, um eine Klaue, einen Haken oder ein anderes Objekt zum Ergreifen von Früchten auf eine bestimmte Stelle zu richten. Dieses Spiel fordert sie heraus, indem es die Früchte automatisch wechselt. Obwohl eine vertikale, gestrichelte Ziellinie mit einer Greifhand am oberen Rand des Behälters verbunden ist, läuft der Spieler Gefahr, die falsche Frucht fallen zu lassen, wenn er die Linie benutzt.
In Fruit Fusion bewegt sich die untere Hand schnell zu einer anderen Frucht. Wenn der Spieler mit dem Bildschirm interagiert, um die Ziellinie zu benutzen, die Figur fallen zu lassen oder aus irgendeinem anderen Grund, bewegt sich diese Hand oft zu schnell. Infolgedessen wechselt das Spiel manchmal im letzten Moment von der aktuell verfügbaren Frucht zur nächsten, was dazu führen kann, dass der Spieler die falsche Figur fallen lässt.