Flag Puzzle Jam: Collect Flags ist ein pädagogisches Puzzlespiel mit einem Match-3-Sortierelement. Der Spieler wählt schmale Stoffstreifen in Dreiergruppen aus, um Flaggen zu erstellen. Am Ende eines jeden Levels erhält er den Namen des Landes, das durch eine Flagge repräsentiert wird, und Goldmünzen als Belohnung.
Das Spiel findet auf einer hölzernen Tischplatte statt, die mit Ausschnitten versehen ist. In der Mitte des Spielfeldes erhält der Spieler ein- oder mehrlagige auf- und abgerollte Stoffstreifen in einem Bereich. Er muss die Streifen in der richtigen Reihenfolge auswählen, damit sie zu einer oder mehreren Flaggen passen, die als verblasste Bilder in Abschnitten am oberen Rand des Tisches dargestellt sind.
Flag Puzzle Jam: Collect Flags bietet den Spielern mehrere Methoden, die das Sortieren dieser Streifen erleichtern. Sie erhalten leere Fächer, die für die Aufnahme von gerollten Streifen vorgesehen sind. Sie verwenden diese Felder wie freie Zellen, wenn sie einen oder mehrere Streifen entfernen müssen, um teilweise verdeckte Teile freizulegen. Anfangs erhalten sie drei Schlitze. Auf den Stufen 10, 15, 21 und 28 schaltet das Spiel weitere Schlitze frei.
Der Spieler erhält Zugang zu den Booster-ähnlichen Werkzeugen unterhalb des mittleren Bereichs, zu denen die Schaltflächen "Level neu laden", "Letzten Zug rückgängig machen" und "Mischen" gehören. Er bezahlt für den Zugang mit den Münzbelohnungen. Er kann seine Belohnungen am Ende eines jeden Levels verdoppeln, indem er sich Videos ansieht.