Disassemble Square ist ein logisches Puzzlespiel aus der Unterkategorie der Parkplatzspiele. Der Spieler muss Muster aus verpixelten, rund-eckigen quadratischen Steinen, die mit schwarzen Pfeilen markiert sind, von einem dunklen Hintergrund entfernen. Andere Ziele gibt es nicht. Sie erhalten keine Punkte oder gewinnen etwas. Sie schalten lediglich neue Muster frei, indem sie mit Logik und verschiedenen Strategien alle Kacheln aus jedem Level entfernen.
In jedem Level zeigt das Spiel ein Muster aus Kacheln mit Pfeilen, die in verschiedene Richtungen zeigen. Der Spieler muss alle Steine entfernen, indem er sie in einer bestimmten Reihenfolge auswählt, die mit den Randsteinen beginnt, die von den anderen Steinen wegzeigen. Wenn der Spieler ein offenes Plättchen auswählt, rutscht das Plättchen direkt aus dem Muster und vom Rand des Bildschirms weg.
Disassemble Square bestraft den Spieler nicht dafür, dass er ein blockiertes Plättchen auswählt, wie es bei einigen ähnlichen Spielen der Fall ist. Die ausgewählten und benachbarten Steine führen einfach keine Bewegungen aus. Allerdings kann das Spiel versteckte Optionen oder pfeilbasierte Muster in größeren Kachelmustern anbieten, die diese Regel ändern.
Zum Beispiel kann der Spieler plötzlich vor einem Szenario stehen, in dem alle verbleibenden Kacheln durch nach innen gerichtete Pfeile blockiert sind. In einigen Levels muss er von vorne beginnen. Auf anderen Ebenen müssen sie einige der Spielsteine umdrehen. Das Spiel gibt den umdrehbaren Spielsteinen eine andere Farbe, aber es erklärt dem Spieler diese Option nicht. Die Spieler müssen die Regeländerungen zu jeder Zeit erraten. In mindestens einem Level müssen sie zum Beispiel Reihe für Reihe Randsteine in einer Spirale von den Rändern nach innen auswählen, um die mittleren Steine freizulegen und zu entfernen.