Cup Sort Puzzle 3D ist ein dreidimensionales Sortierspiel mit einem Getränkethema. Obwohl sich der Titel auf Tassen bezieht, beginnt das Spiel mit Dosen. Der Spieler sortiert Getränkedosen in Kisten. Wenn er diese Aufgabe in jedem Level erfüllt, enthüllt er ein Sammelauto oder einen Städtebau-Aufkleber, den das Spiel in ein Aufkleberbuch überträgt.
Dieses Spiel ist ähnlich wie Hardware- und Fadensortierspiele. Es weist jedoch einen großen Unterschied auf. Der Spieler muss nicht jede Dose anwählen, um das Spiel aufzufordern, sie in eine passende Box zu übertragen. Die Dosen fallen in Rutschen in die Mitte des Bildschirms. Wenn der Spieler nebeneinander liegende, passende Dosen auswählt, werden alle benötigten Dosen automatisch in eine farb- und logogleiche Schachtel übertragen. Wählt der Spieler jedoch einen Bereich mit nicht passenden Dosen aus, wandert eine einzelne Dose in eines der sechs leeren Fächer unterhalb der Rutschen.
Wenn der Spieler keine Fächer mehr hat, verliert er das Level. Wenn er bereit ist, sich eine Werbung anzusehen, kann er jederzeit zwei weitere Fächer freischalten, um einen Verlust zu verhindern. Er kann auch eine Werbeeinblendung nutzen, um weiterzuspielen, nachdem er einen kritischen Fehler gemacht hat. Auch auf diese Weise können sie zwei weitere Kisten freischalten. Zusätzlich bietet das Spiel drei Booster am unteren Rand des Bildschirms, die ihnen helfen, Fehler zu korrigieren und ohne Unterbrechung zu spielen.
In Cup Sort Puzzle 3D kann der Spieler keine Dosen auswählen, die auf allen Seiten in einer Rutsche blockiert sind. Der Spieler kann nur von unten auswählen, was im Spiel als "Vorderseite" bezeichnet wird.
