Cube Crash ist ein Puzzle-Spiel, das ähnlich wie die Spiele Halloween Monster Puzzle, Sea Diamonds Challenge und Tiles of the Simpsons funktioniert. Der Spieler versucht, 12 Levels mit der höchstmöglichen Punktzahl abzuschließen, indem er einen Satz von drei oder mehr benachbarten, farblich passenden Würfeln auf einem Gitter auswählt.
Das Spiel zeigt blaue, grüne, orange und violette Würfel, die in einem Rahmen auf dem Spielfeld gestapelt sind. Wenn der Spieler mit dem Mauszeiger über eine Gruppe passender benachbarter Würfel fährt, leuchtet die Gruppe auf, und das Spiel zeigt die mögliche Punktzahl für das Entfernen dieser Gruppe an. Wenn der Spieler die Gruppe auswählt, fallen die Würfel vom Spielfeld und vom Bildschirm. Wenn sie eine Spalte entfernen, verschieben sich die verbleibenden Spalten nach links oder rechts, wodurch neue Würfelsätze entstehen. Obwohl das Spiel nicht verlangt, dass der Spieler alle Würfel entfernt, und dies auch eher selten der Fall ist, kann er mit etwas Glück und strategischem Spiel das gesamte Feld abräumen.
Cube Crash aktualisiert den Punktestand des Spielers während des Spiels in der rechten hellblauen Seitenleiste. Wenn der Spieler besser abschneidet als das Ziel, erhält er Bonuspunkte. Der Spieler kann auch die aktuelle Levelnummer und das Ziel des Levels einsehen.
Wenn der Spieler das Spiel beendet hat, kann er seine Punktzahl auf einer Rangliste eintragen, die Spieler aus der ganzen Welt repräsentiert. Der Spieler kann seine täglichen, wöchentlichen und monatlichen Punktzahlen aufzeichnen. Sie können auch ihre Gesamt- und Allzeit-Punktzahl einsehen.