Cool Balls ist ein Bubble Shooter mit einem einzigartigen 2048-Merge-Element. Der Spieler schießt mit einer gelben Kanone bunte, nummerierte Bubble-Ball-Projektile in einen Behälter, der gegen dynamische Gaswolken im Weltraum gerichtet ist. Mit jedem Schuss versucht er, Blasen mit höherer Nummer zu erzeugen, indem er passende Blasen zusammenfügt. Sie versuchen auch, Münzen zu verdienen, um Booster zu kaufen und so lange wie möglich zu spielen.
Der Spieler schießt das erste Projektil in den leeren Behälter. Der Blasenball schwimmt nach oben. Dann schießt der Spieler weitere Geschosse ab. Rechts neben dem Schützen sieht er jederzeit eine Vorschau auf die nächsten fünf Geschosse. Mit dieser Information kann er seine Schüsse planen, um sein Merge-Potenzial zu erhöhen.
Wie bei anderen Bubble Shootern wird auch bei Cool Balls eine Kraft am oberen Rand des Behälters eingesetzt, um die darin befindlichen Bubble Balls in Richtung einer roten horizontalen Straflinie am unteren Rand zu drücken. Wenn die Kugeln diese Linie berühren, endet das Spiel.
Um dies zu verhindern, muss der Spieler genügend Schüsse hintereinander abgeben, um Energie zu sammeln, die eine von mehreren grauen Plattformen zerstören kann, die die Abwärtsbewegung antreiben. Wenn er genug Münzen verdient hat, kann er auch einen Booster kaufen, der jede Plattform mit einem Zug entfernt. Das Spiel ermöglicht den Zugang zu diesem Booster, indem man sich ein Video ansieht.
Der Spieler verfolgt seine Gold- und Silbermünzen im unteren rechten Bereich über den Vorschaugeschossen.
