Color Yarn Sort ist ein Sortierspiel, das Ähnlichkeiten mit Hardware- und Parkplatzsortierspielen aufweist. Die Aufgabe des Spielers ist es, farbiges Garn auf Holzspulen in farblich passende Körbe in verschiedenen Levels zu bringen. Für seine Bemühungen erhält er Goldmünzen.
Der Spieler veranlasst das Spiel, einen Transfer durchzuführen, indem er einen Korb in eine optimale Position bringt. In jedem Level befinden sich die Garnspulen auf vertikalen Förderbändern am oberen Bildschirmrand, fünf leere Produktionsplätze in der Mitte und eine Mischung aus Körben in einer Ablage unterhalb der Plätze. In den meisten Levels sind einige der Körbe in die Ablage gedrückt. Der Spieler muss eine bestimmte Anzahl anderer Körbe verwenden, bevor ein nicht verfügbarer Korb auftaucht.
Angesichts der begrenzten Anzahl von Plätzen muss der Spieler die Körbe so auswählen, dass sie zu den Garnfarben passen, die sich am nächsten am Boden der Förderbänder befinden. Während des Transfers zeigt das Spiel den verbleibenden Platz in einem Korb auf einem horizontalen Fortschrittsbalken neben dem Korb an. Einen vollen Korb verschließt es mit einem Plastikdeckel, bevor es den Behälter vom Bildschirm verschwinden lässt.
Color Yarn Sort bietet unterhalb des Transferbereichs drei Booster, die zu bestimmten Zeiten freigeschaltet werden. Mit dem ersten kann der Spieler automatisch Garn von einer beliebigen Spule in einen Korb befördern. Mit dem zweiten kann er einen nicht verfügbaren Korb auswählen und benutzen. Und schließlich kann der Spieler einige Garnspulen nach dem Zufallsprinzip umschichten.