Color Sort Puzzle ist ein Sortierspiel. Der Spieler sortiert in den Levels mit oder ohne Zeitbegrenzung farbige Flüssigkeiten in Reagenzglasflaschen. Das Ziel ist es, alle Flüssigkeiten so zu sortieren, dass jedes Fläschchen eine Farbe enthält, und Punkte neben den roten Herzen in der oberen Mitte des Bildschirms zu sammeln. Sie können auch mehr Punkte mit einem Multiplikator und Zugang zu hilfreichen Spezialwerkzeugen erhalten, indem sie Werbevideos ansehen.
Im Zeitmodus versucht der Spieler, innerhalb einer vorgegebenen Zeit von einer Minute so viele Fläschchen wie möglich zu sortieren und zu füllen, während er sich durch schnelles Spielen zusätzliche Zeit verdient. Er verliert das Spiel, wenn er nicht mehr genug Zeit hat, um ein Level abzuschließen. Im Levelmodus sortieren sie die Bänder mit den farbigen Flüssigkeiten in ihrem eigenen Tempo.
Color Sort Puzzle bietet mehrere Werkzeuge, die dem Spieler helfen. Mit dem Zurück-Pfeil in der unteren Mitte des Bildschirms können sie ihre Züge bis zu fünf Mal rückgängig machen. Er kann dem Spielfeld zusätzliche Fläschchen hinzufügen. Mit der Pfeil-nach-rechts-Taste können sie auch ein Level überspringen. Wenn ihnen diese Möglichkeiten ausgehen, können sie 500 Herzpunkte ausgeben oder Werbevideos ansehen, um mehr zu erhalten.
Im Spiel können sie ihre Herzpunkte auch verwenden, um die Flaschen zu verschiedenen Größen und Arten von Behältern aufzurüsten und das Hintergrundthema zu ändern. Das Spiel beginnt mit einem nächtlichen Himmel im Hintergrund. Der Spieler kann ihn zum Beispiel zu einem hellblauen Taghimmel mit Wolken aufwerten.
