Bubble Tower ist ein gelegentlicher Bubble-Shooter, ähnlich wie Bubble Tower 3D. In einer dreidimensionalen Umgebung entfernt der Spieler Muster von Seifenblasenkugeln, die an zylindrischen Türmen befestigt sind, indem er Projektile verwendet, um passende Cluster zu erstellen und fallen zu lassen. Er muss diese Aufgabe in jedem Level erfüllen, bevor ihm die Kugeln ausgehen. Mit jedem Sieg verdient er Münzen und schaltet neue, anspruchsvollere Level frei.
Ein Level besteht in der Regel aus einem glatten, weißen Säulenturm, an dessen Seiten oben und in der Mitte gemischtfarbige Kugeln hängen. Jeweils ein einzelnes Projektil ruht auf einem horizontalen, farblich passenden Band am unteren Rand des Bildschirms. Eine Registerkarte in der unteren linken Ecke zeigt die Anzahl der verfügbaren Kugelgeschosse an.
Der Spieler benutzt seine Steuerelemente, um den Turm nach links oder rechts zu drehen, um die Kugeln mit dem niedrigsten Muster auf den Schützen auszurichten. Der Spieler kann die Kugeln nur abwerfen, wenn sie Gruppen von drei oder mehr farblich passenden Kugeln bilden.
Bubble Tower belohnt den Spieler mit den meisten Münzen, wenn er nicht alle seine Kugeln abschießt. Die Münzen helfen dem Spieler, die Kugeln schneller fallen zu lassen, und zwar mit drei Boostern unterhalb des Shooters, die freigeschaltet werden, nachdem sie bestimmte Level erreicht haben.
