Bubble Dropper ist ein Bubble-Popping-Spiel, das sich durch eine einzigartige Spielmethode auszeichnet. Anstelle eines klassischen Layouts mit einem Zeiger-Shooter, der auf Blasen zielt, die in Reihen hängen, hat es ein Loch in der Mitte, das bunte Standard- und Power-Booster-Blasen auf einen zentralen Pfosten fallen lässt, der sich wie ein Rad dreht.
Der Spieler zielt nicht auf die Blasen auf dem Rad und schießt sie ab. Er sucht nach Match-3- und Booster-Möglichkeiten und dreht dann das Rad, indem er auf einer horizontalen Kette am unteren Rand des Bildschirms nach links und rechts gleitet. Diese Aktionen veranlassen zwei getarnte Figuren dazu, die Kette mit manuellen Handwinden zu bewegen. Ziel des Spielers ist es, alle Blasen von der Säule zu entfernen und in 100 Leveln die höchste Grund- und Zeitbonuspunktzahl zu erreichen.
Bubble Dropper stellt den Spieler vor viele verschiedene Hindernisse, wie z.B. Eis, das die Blasenfarben verdeckt, und feste, unbesiegbare Steine. Obwohl Power Bubbles helfen, einige dieser Herausforderungen zu lösen, werden die Booster nicht durch die Aktionen des Spielers generiert oder als separate Optionen angeboten.
Das Spiel lässt Energieblasen nach dem Zufallsprinzip aus demselben Loch wie die normalen farbigen Blasen fallen. Zu den üblichen Kräften gehören Flammen, die Gruppen gemischter Blasen wegbrennen, Blitze, die alle farblich passenden Blasen entfernen, Portale, die eine oder mehrere Blasen einer beliebigen Farbe aus dem Spielbereich ziehen, regenbogenfarbene Strudel, die sich in passende Blasen verwandeln, und Sterne, die alle verbleibenden Blasen und andere Objekte entfernen.