Bottle Sort ist ein Sortierspiel. Auf einem 4x6-Tisch erfüllt der Spieler Aufgaben, indem er kleine farbige Flaschen auf Tabletts sortiert. Von Level zu Level besteht das Ziel darin, eine bestimmte Anzahl von Flaschen nach Farben zu sammeln und Goldmünzen mit Sternen zu verdienen.
Dieses Spiel ähnelt am meisten den Hex-Stack-Plattensortierspielen. Es zeigt eine oder mehrere Sammelaufgaben in der oberen Mitte über dem Tisch und drei Tabletts mit farblich gemischten Flaschen unter dem Tisch. Der Spieler verschiebt die Fächer auf leere horizontale Felder auf dem Tisch und erhält dann ein neues Set.
Um Flaschen entsprechend der Aufgaben zu sammeln, z. B. 1 blaue Flasche, muss der Spieler ein Tablett mit sechs Flaschen der gleichen Farbe füllen. Er kann nur dann Flaschen von einem Tablett auf ein anderes verschieben, wenn er die Tabletts in benachbarte Positionen bringt.
Stellt der Spieler zum Beispiel ein Tablett mit drei blauen Flaschen neben ein Tablett mit einer blauen und zwei grünen Flaschen, wird die blaue Flasche auf ein leeres Feld auf dem Tablett mit den blauen Flaschen gestellt. Wenn der Spieler das Tablett füllt, lässt das Spiel es verschwinden und reduziert die Sammelzahl für blaue Flaschen um einen Punkt. In einigen Levels deckt das Spiel versteckte Aufgaben auf, nachdem der Spieler die ersten Aufgaben erfüllt hat.
Bottle Sort bietet auch andere Hindernisse, wie z.B. Kisten, die den Platz auf dem Tisch blockieren. Der Spieler kann eine Kiste nur aufbrechen, um einen Platz freizumachen, indem er ein Tablett an einer Stelle neben der Kiste füllt. Er muss nicht alle Kisten zerstören, um ein Level zu gewinnen, aber er kann seinen Münzgewinn dadurch erhöhen.