Block Puzzle 3D ist ein wettbewerbsfähiges Block-Puzzle-Spiel mit dreidimensionalen Teilen. Auf einem dunkelblauen, schwebenden 8x8-Gitter versucht der Spieler, so viele Acht-Block-Linien wie möglich mit 3D-Polyomino-Formen zu bilden, um eine hohe Punktzahl zu erreichen. Das ultimative Ziel ist es, die Punktzahl anderer Online-Nutzer zu übertreffen, die auf einer horizontalen Linie am oberen Rand des Bildschirms angezeigt wird.
Das Gitter ist nicht vertikal angeordnet, wie bei den meisten ähnlichen Blockpuzzlespielen. Stattdessen befindet sich die Kameraansicht in einem Winkel, der es schwieriger macht, Teile des Gitters beim Platzieren der Formen klar zu erkennen. Der Spieler erhält jeweils drei Formen unterhalb des Gitters. Er muss alle drei verwenden, bevor das Spiel ihm weitere gibt.
Der Spieler spielt so lange weiter, bis er keinen Platz mehr im Gitter mehr hat. Er erhält Punkte in der oberen Mitte, wenn er eine Linie erstellt und entfernt und eine Kombinationsreihe von Entfernungen durchführt. Wenn er verliert, kann der Spieler versuchen, seine höchste Punktzahl zu übertreffen, wenn er von vorne beginnt. Das Spiel zeigt die Zahl im oberen linken Bereich neben einem goldenen Trophäensymbol an.
Block Puzzle 3D verfügt außerdem über einen Speicherbereich rechts neben dem Dreiformen-Set. Wenn der Spieler keinen Platz mehr auf dem Gitter hat, um den letzten Block in einem Set zu platzieren, kann er ihn in diesen Bereich verschieben, um das Spiel zu veranlassen, ein neues Set zu erstellen.