Kugeln: Cifrobus ist ein 2048-Spiel im Verbindungsstil. Der Spieler benutzt Verbindungslinien, um nummerierte Kugeln zu verbinden, um Aufgaben zu erfüllen, die höchstmögliche Punktzahl zu erreichen und genug Münzen zu verdienen, um Themen-Upgrades durchzuführen.
Der Spieler beginnt mit nummerierten Kugeln in Reihen vor einem weißen Hintergrund. Er muss zunächst beweisen, dass er das Spiel verstanden hat, indem er eine bestimmte Aufgabe erfüllt. Dann versucht er, benachbarte, identisch nummerierte Kugeln über Verbindungslinien zu höher nummerierten Kugeln weiterzuentwickeln.
Obwohl Bälle: Cifrobus dem Spieler erlaubt, mehr als zwei Kugeln mit einer Verbindungslinie zu verschmelzen, verdoppelt es nur den Wert von jeweils zwei. Wenn der Spieler zum Beispiel eine Linie über drei 16er-Kugeln zieht, entsteht eine einzige 32er-Kugel. Wenn er vier Kugeln mit einem Zug verbindet, entsteht eine 64er Kugel. Der letzte Verbindungspunkt ist der, an dem die neue Kugel auf dem Hintergrund entsteht. Die Lücken, die durch das Verschwinden der zusammengefügten Kugeln entstehen, werden mit neuen Kugeln gefüllt, die von oben herabfallen.
Der Punktestand wird über einem horizontalen Fortschrittsbalken im oberen Bereich angezeigt. Wenn der Spieler Goldmünzen verdient hat, erscheint auf der linken Seite eine ausklappbare Registerkarte. Sie erhalten die Münzen als Gewinne am Ende jedes Levels, als tägliche Belohnungen und als Preise in der Werbeanzeige. Münzen erscheinen auch zufällig auf den Formen.
Das Spiel bietet dem Spieler anfangs eine zeitlich begrenzte, kostenlose Option zur Verdopplung der Belohnung, wenn er Münzen aus zusammengelegten Kugeln sammelt. Nach dem ersten Mal müssen sie Werbung sehen, um sie zu nutzen. Mit den Münzen können sie neue Hintergrund- und Ballhautfarben kaufen. Sie können die Bälle auch umwandeln, um mit anderen Formen zu spielen. Wenn sie sieben Tage in Folge fusionieren, erhalten sie ein kostenloses Themen-Upgrade.