Worm Apple Quest er et logisk-puslespil med slanger. På 50 niveauer hjælper spilleren en orm med at finde og spise skinnende farverige æbler i nærheden af flydende platforme, der svæver foran grønne baggrunde.
Spillet præsenterer en bred vifte af æblefarver, fra grøn til gylden. Æblerne hænger mystisk på himlen eller hviler på toppen af en platform. Spilleren kan få ormen til at bevæge sig op, ned, til venstre og til højre. De kan også få den til at vende og glide på begge sider af kroppen og bøje sig hen over hjørner. Men hvis spilleren bøjer ormens krop til en firkant, kan han ikke flytte den til nye positioner og må starte niveauet forfra.
Når spilleren har fået ormen til at spise alle æblerne, viser spillet de tilknyttede point. Spilleren bruger til sidst pointene til at opgradere ormens udseende til en af 10 nye hudfarve- og mønsterkombinationer. Hvis spilleren ikke har nok æbler, kan han eller hun tjene flere ved at se en reklame.
Worm Apple Quest giver spilleren mulighed for at genindlæse et niveau når som helst med en halvcirkelformet genindlæsningsknap øverst på skærmen. Det giver også spilleren mulighed for at springe et niveau over når som helst med en annoncevisning.