UFO Puzzle er et sorteringsspil med match-3-regler. Spillerens mål er at sortere pingviner i matchende sæt for at rydde gitre og tjene hammere, der hjælper dem med at bygge genstande på flydende landmasser.
Spillet er opdelt i tre minispil pr. niveau. På hvert niveau får spilleren et gitter med farverige pingviner, der bærer byggehatte, pilotkasketter, kaninører og anden hovedbeklædning. De får også syv felter i en vandret række under gitteret. De skal omhyggeligt sortere pingvinerne i match-3-sæt baseret på farve og hattestil.
Spilleren skal typisk flytte ikke-matchende pingviner til felterne for at få adgang til matchende pingviner, hvilket hurtigt kan fylde de tilgængelige felter op. De mister et minispil og skal starte forfra på et niveau, hver gang de fylder alle pladser uden at skabe et sæt. Hvis de afslutter et niveau, får de mønter og hamre og kan derefter bygge genstande på øerne.
UFO Puzzle giver spilleren mange udfordringer, herunder sovende pingviner i kedelige farver, skjulte pingvin-snefolk og mystiske pingvin-elevatorkasser. Spilleren skal bruge forskellige strategier for at afsløre kampe. For eksempel kan de huske farverne på de sovende pingviner og derefter beregne antallet af træk, der er nødvendige for at nå en eller flere for at fuldføre et matchende sæt.
Som med andre match-3-spil har dette spil boostere, herunder en baglæns pil, der vender det sidste træk, snoede dobbeltpile, der blander pingvinerne, og en magnet, der automatisk vælger et matchende sæt. Der er også en booster med tre brikker, som skaber et midlertidigt placeringsområde for at frigøre pladser. Spilleren kan købe flere boostere med møntgevinster eller se annoncer. De kan gøre krav på yderligere mønter og boostere, når de er færdige med at renovere og deltager i særlige begivenheder.
