Shoot at the Bubbles er et afslappet boblespil med en blanding af klassisk neonarkadegrafik og moderne interface-ikoner. Spilleren skyder bobleprojektiler mod matchende klynger i rækker af hængende overlappende bobler for at opnå en høj score og låse op for så mange niveauer som muligt.
Spilleren starter med 1.000 gratis mønter. De bruger butiksikonet i højre side af skærmen til at købe særlige værktøjer, der kan hjælpe dem med at spille længere. For eksempel kan de købe en swap-booster, der giver dem mulighed for at ændre projektilets farve, en multiplikator, der fordobler deres score, når den aktiveres, og en row clear-booster, der fjerner en hel række af bobler.
Shoot at the Bubbles er det samme som andre lignende spil. Spilleren skaber klynger af tre eller flere forbundne matchende bobler med sine projektiler. Men i dette spil falder der en række nye bobler efter hvert 10. skud i stedet for efter et bestemt antal fejlskud. De overlappende bobler ligner også fiskeskæl, hvilket gør det svært at se huller og steder, man kan ramme med skyttens sigtelinje og målboble.
