Fairy Sweet Balls er et bubble-popping-spil. Feen Sofia har brug for spillerens hjælp til at besejre monstre i emoji-stil, som har stjålet søde sager i hele landet. Spilleren samler desserter og snacks ved at slå monstrene ned fra hængende rækker med projektiler. De skal samle et bestemt antal godbidder i hvert område for at opnå sejr.
Spilleren modtager seks monsterprojektilhoveder. De kan ikke bytte projektilerne, men forhåndsvisningen giver dem mulighed for at lave en strategi med seks skud, før de bruger det første. De fjerner typisk rækkehovederne ved at bede Sofia om at kaste hovedprojektilet mod to eller flere matchende monstre, der befinder sig tæt på hinanden eller på tværs af en lille kløft. De kan nogle gange bruge lignende hoveder, der viser forskellige følelser, til at danne en klynge.
Monsterboblerne falder ned fra rækkerne og springer derefter. Eventuelle ikke-matchende vedhæftede bobler springer også. Når det er sagt, dannes der ikke en klynge, når der er et hul på nogle niveauer. Derudover rammer nogle monsterhovedprojektiler en sammenhængende gruppe af matchende bolde og springer derefter bare væk uden advarsel. Projektiler preller også af på desserter.
Fairy Sweet Balls hjælper nogle gange spilleren med forskellige powerballs, der giver en sigtelinje og en målpil. Disse bobleværktøjer omfatter en sort bombe, der fjerner en stor ikke-matchende klynge, et hvirvelslik, der rammer flere mål via en hoppende bevægelse, og en regnbuebold, der matcher ethvert monsterhoved.