Color Water Sort 3D er en tredimensionel version af det populære klassiske sorteringsspil, hvor spilleren skal sortere vand i forskellige farver i separate laboratorieprøverør og andre beholdere. I denne version skal spilleren også spille hurtigt nok til at optjene tre guldstjerner.
På tværs af niveauer overfører spilleren de farvede vandbånd. Når de fylder et reagensglas med en farve, sætter spillet en prop i det og skyder konfetti op på skærmen. Når de gennemfører en bane, får de stjerner og guldmønter. De kan gange deres møntgevinster ved at stoppe en pil på en X2- til X5-multiplikatormåler. De kan også vinde mønter ved at åbne en sparegris og spille på et spin-hjul på startskærmen, tage imod en gaveæske med belønning for fremskridt og samle nøgler til at åbne skattekister.
Hvis spilleren begår en fejl, kan han/hun bruge tilbageknappen øverst til højre på den vandrette stjerne-fremdriftslinje øverst i midten. Hvis de har brug for at tilføje et ekstra reagensglas, kan de bruge tilføj-knappen øverst til venstre på bjælken. Spillet giver dem også mulighed for at se et hint med forstørrelsesknappen i øverste højre hjørne eller springe et niveau helt over med pileknappen i øverste venstre hjørne under startknappen.
Color Water Sort 3D giver spilleren mulighed for at tilpasse sin oplevelse med sine møntgevinster. De kan bruge mønterne til at låse op for tilfældige nye reagensglasformer, baggrunde og propper.
