Color Sort Puzzle er et sorteringsspil. På tværs af niveauer i spillet med eller uden tidtagning skal spilleren sortere farvede væsker i reagensglas. Målet er at sortere alle væsker, så hver kolbe indeholder én farve væske, og optjene point ved siden af de røde hjerter øverst i midten af skærmen. De kan også optjene flere point med en multiplikator og få adgang til nyttige specialværktøjer ved at se reklamevideoer.
I spillet på tid skal spilleren forsøge at sortere og fylde så mange kolber som muligt på tværs af banerne inden for et minut, mens han eller hun optjener ekstra tid ved at spille hurtigt. De taber spillet, når de ikke længere kan optjene nok tid til at gennemføre en bane. I niveauerne sorterer de båndene med farvede væsker i deres eget tempo.
Color Sort Puzzle har flere værktøjer til at hjælpe spilleren. De kan fortryde deres træk op til fem gange med en tilbage-pil nederst i midten af skærmen. De kan tilføje ekstra kolber til spillepladen. De kan også springe et niveau over med en højre-pil-knap. Hvis de løber tør for disse muligheder, kan de bruge 500 hjertepoint eller se reklamevideoer for at få flere.
Spillet giver dem også mulighed for at bruge deres hjertepoint til at opgradere flaskerne til forskellige størrelser og stilarter af beholdere og ændre baggrundstemaet. Spillet begynder med en nattehimmel i baggrunden. Spilleren kan opgradere den til f.eks. en lyseblå daghimmel med skyer.
