Bubble Shooter: Aquarium er et boblesprængningsspil. På fem niveauer bruger spilleren en sjælden spinner-shooter til at sprænge hængende rækker af bobler, der indeholder farverige fisk. Målet er at fjerne alle bobler og opnå den højeste niveau- og spinner-score.
Spillet viser de hængende rækker i midten af skærmen og skyderen med op til tre udskiftelige fiskebobleprojektiler. Spilleren kan bruge et hvilket som helst af projektilerne ved at vælge de hvide dobbeltpile mod den grønne midte af spinneren.
Øverst til venstre på skærmen er der et akvarium i gråtoner under en prestigefyldt pointtæller. Når spilleren foretager fortløbende skud, der fuldender farvematchende klynger af tre eller flere bobler, tilføjer spillet en lille smule farve til akvariet. Spilleren modtager spinner-bonusscoren, når de farver det helt.
Bubble Shooter: Aquarium tilbyder strafpas i området nederst til venstre. Hvis spilleren ikke får boblerne til at springe, reducerer spillet et tal over en pil ned, indtil det når nul. Derefter falder der en ny række.
Fiskene distraherer ofte ved at svømme ind i boblerne. Som følge heraf hjælper afleveringerne spilleren med at reducere antallet af straffe, de får for manglende træffere.
