Bubble Birds er et boblespil med et redningstema. På en tropisk ø forsøger spilleren at befri fugleunger fra hængende rækker, stige i niveau ofte og opnå en høj score.
Øen besøges af forskellige fuglearter, bl.a. blåfugle, kardinaler, kolibrier, papegøjer og spætter. På et røgfyldt panel bruger spilleren bubble shooter-action til at bringe fugleungerne tilbage til deres forældre. Spillet giver dem en utraditionel skyder i form af en rede lavet af kviste, der hviler oven på en tangdækket sten.
Spilleren modtager én fugleunge i reden ad gangen. De skyder en fugleunge mod to eller flere matchende, forbundne fugleunger for at skabe et kobbel eller en gruppe. Når de skyder præcist, kommer der røg på skærmen, og ungerne forsvinder med et glimt af fjer. Alle ikke-matchende unger, der er knyttet til gruppen, falder ned i bunden af skærmen.
Bubble Birds smider tilfældigt nye rækker af fugleunger på panelet over tid. Spilleren får ikke noget forvarsel. Straffe sker typisk, hvis de ikke klarer et bestemt antal skud i træk. De får point for standardtræffere og kombinationsrækker.
Dette spil indeholder også flere finurlige, tilfældige udfordringer eller glitches. Hvis spilleren vinkler et skud mod en sidevæg, kan fugleprojektilet bytte plads med et, der allerede ligger i rækken. Hvis de rammer en enkelt matchende fugl, tæller spillet måske træffet som en gruppe på tre fugle. Endelig springer nogle projektiler, når de rammer sidevæggene.
