Ve hře Puppy Cupcake převezměte kontrolu nad pekárnou a připravujte různé dortíky a další pochoutky. Během hry hráč míchá všechny ingredience jednu po druhé a teprve poté je peče. Jakmile je vyndá z trouby, může je ozdobit.
Každá ingredience je na stole a je označena. Šipka ukazuje, které přísady je třeba přidat do mísy jako první. Přetahování ingrediencí do mísy je někdy pomalé, ale po přetažení ze stolu se do mísy nasypou poměrně rychle. První úrovně hry Puppy Cupcake obsahují základní ingredience a recepty. Postupem hry se přidávají další příchutě a je k dispozici více dekorací, takže cupcaky vypadají trochu jedinečněji. Každý krok procesu míchání, nalévání a pečení je zobrazen tak, aby se cupcaky nepřipálily. Z těsta lze vystřihovat ozdoby, které lze umístit na vrchol cupcakes, a lze použít i barevné polevy. Některé pokyny nejsou jasné, takže je obtížné zjistit, jak těsto vyválet, aby bylo možné vytvořit některé ozdoby. V průběhu hry lze získat ocenění za míchání ingrediencí, pečení a zdobení. Na výběr jsou tři košíčky, přičemž každý z nich má jiný design.
